MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008346	AAGA	2	8	16	23	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008346	CAA	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008346	GAAA	2	8	2683	2690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008346	GATA	2	8	2691	2698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008346	GGGA	2	8	8454	8461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008346	GGT	2	6	9359	9364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008346	TAA	2	6	9422	9427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008346	TGA	2	6	9436	9441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008346	AG	3	6	9472	9477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008346	TGG	2	6	9479	9484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008346	TA	3	6	9534	9539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008346	GGT	2	6	9543	9548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008346	CAA	2	6	9583	9588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008346	T	6	6	9636	9641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008346	AGG	2	6	9665	9670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008346	ATA	2	6	9701	9706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008346	AGG	2	6	9726	9731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008346	GCG	2	6	10936	10941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008346	CTATAG	2	12	10978	10989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008346	GA	3	6	10993	10998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008346	TAA	2	6	12635	12640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008346	GAAT	2	8	12746	12753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008346	AGG	2	6	12762	12767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008346	AAG	2	6	14078	14083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008346	TTGCA	2	10	14107	14116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008346	AGG	2	6	14155	14160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008346	CCT	2	6	14211	14216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008346	GA	3	6	14346	14351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008346	TAA	2	6	14398	14403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008346	CT	4	8	14425	14432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008346	GC	3	6	14514	14519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008346	T	7	7	14554	14560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008346	ATA	2	6	14679	14684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008346	TAA	2	6	14728	14733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008346	C	7	7	17471	17477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_008346	TA	3	6	17584	17589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008346	TTTA	2	8	17597	17604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008346	ATA	2	6	17617	17622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008346	T	7	7	17641	17647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008346	GTT	2	6	17670	17675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008346	GT	3	6	17736	17741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008346	CTT	2	6	17747	17752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008346	TTA	2	6	17768	17773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008346	GGC	2	6	17782	17787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008346	TAG	2	6	17834	17839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008346	TCT	2	6	17842	17847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008346	AGA	2	6	17864	17869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008346	G	6	6	17898	17903	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008346	TCA	2	6	17906	17911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008346	TTTTAA	2	12	17954	17965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008346	AAC	2	6	18038	18043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008346	CTCGA	2	10	18639	18648	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008346	CT	3	6	18693	18698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008346	AT	3	6	18704	18709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008346	GAT	2	6	18710	18715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008346	T	8	8	18740	18747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008346	GTA	2	6	18751	18756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008346	TCA	2	6	18760	18765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008346	GCA	2	6	18907	18912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008346	TCC	2	6	21107	21112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008346	TTTAG	2	10	21116	21125	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008346	TCAG	2	8	21142	21149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008346	GT	3	6	21152	21157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008346	ATT	2	6	21187	21192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008346	ATATA	2	10	21193	21202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008346	TAT	2	6	21213	21218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008346	GAA	2	6	21229	21234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008346	AAG	2	6	21318	21323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008346	TGT	2	6	21356	21361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008346	A	6	6	21377	21382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008346	GAA	2	6	21389	21394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008346	GCA	2	6	22325	22330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008346	AGC	2	6	22331	22336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008346	AATC	2	8	22380	22387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008346	ATC	2	6	22437	22442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008346	GA	3	6	22498	22503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008346	ATT	2	6	22511	22516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008346	GAA	2	6	22602	22607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008346	GCA	2	6	22654	22659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008346	TAA	2	6	22669	22674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008346	TCCC	2	8	22770	22777	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_008346	ATT	2	6	23302	23307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008346	T	6	6	23324	23329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008346	CTT	2	6	23337	23342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008346	A	6	6	23346	23351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008346	TAG	2	6	23355	23360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008346	ATTA	2	8	23363	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008346	TAA	2	6	23377	23382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008346	CAT	2	6	23442	23447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008346	GCG	2	6	23461	23466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008346	TTG	2	6	23495	23500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008346	ATATC	2	10	23515	23524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008346	GAA	2	6	23620	23625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008346	GAA	2	6	23647	23652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008346	TGGGA	2	10	23653	23662	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008346	AT	3	6	25513	25518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008346	GAT	2	6	27020	27025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008346	T	6	6	27033	27038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008346	ACT	2	6	27039	27044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008346	AT	3	6	27957	27962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008346	CCTT	2	8	27963	27970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008346	TAA	3	9	28008	28016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008346	GGC	2	6	28022	28027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008346	TG	3	6	28106	28111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008346	A	6	6	28141	28146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008346	CCT	2	6	30408	30413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_008346	CAA	2	6	30424	30429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008346	GTA	2	6	30435	30440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008346	GAT	2	6	30459	30464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008346	T	8	8	30464	30471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008346	CTG	2	6	30480	30485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008346	CTC	2	6	30925	30930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008346	ACAA	2	8	30970	30977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008346	AGA	2	6	30987	30992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008346	CGAG	2	8	31623	31630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008346	AT	3	6	31655	31660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008346	TAAA	2	8	31672	31679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008346	TTA	2	6	31707	31712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008346	GTT	2	6	31790	31795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008346	CAA	2	6	31808	31813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008346	AAT	2	6	31908	31913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008346	GGA	2	6	33320	33325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008346	ATT	2	6	34595	34600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008346	AT	3	6	35465	35470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008346	TAA	2	6	35586	35591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008346	CCCT	2	8	35598	35605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_008346	GTTTT	2	10	35616	35625	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008346	A	6	6	35706	35711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008346	GGAA	2	8	35923	35930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008346	GCA	2	6	35931	35936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008346	AAG	2	6	35939	35944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008346	TGGA	2	8	35971	35978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008346	ACT	2	6	35983	35988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008346	TAT	2	6	36113	36118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008346	GAG	2	6	36160	36165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008346	AAT	2	6	37686	37691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008346	GGC	2	6	37708	37713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008346	AT	3	6	38018	38023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008346	AGG	2	6	38041	38046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008346	ATG	2	6	38672	38677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008346	T	6	6	38711	38716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008346	AG	3	6	39016	39021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008346	CTT	2	6	39317	39322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008346	GGC	2	6	39351	39356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008346	C	6	6	39367	39372	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_008346	ATA	2	6	39474	39479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008346	GT	3	6	39608	39613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008346	GTT	2	6	39630	39635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_008346	AGG	2	6	41730	41735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_008346	GAA	2	6	43327	43332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_008346	GGC	2	6	43671	43676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_008346	AGG	2	6	44896	44901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_008346	ACA	2	6	49954	49959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_008346	GTC	2	6	49998	50003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_008346	TCG	2	6	50047	50052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_008346	GA	3	6	52115	52120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
278	NC_008346	GCT	2	6	52845	52850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_008346	AT	3	6	54349	54354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_008346	GTT	2	6	54365	54370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_008346	TAA	2	6	54386	54391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_008346	CTA	2	6	54461	54466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_008346	GGT	2	6	54481	54486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_008346	G	6	6	54504	54509	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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